抗日戰爭勝利后，蘇浙軍區部隊奉命北撤，同時留下少數黨政軍領導干部在原地堅持斗爭。全面內戰爆發后，他們在上級的領導下，重建革命武裝。經過近3年的艱苦奮斗，除恢復了四明、會稽兩塊抗日時期的老根據地外，還向南、向西開辟了廣闊的新地區，基本上實現和浙南、浙西根據地打成一片的目標，建立了四明（含三北）、會稽（路東）、臺屬（州）、金蕭（路西）、路南、東海等6個地區級黨的工委及其武裝，主力發展到6300余人，在解放大軍渡江前后，解放了12個市縣，為浙江全境的解放建立了不朽的業績，為新中國的成立獻上一份厚禮。
隱蔽精干 積蓄力量
1945年9月20日，中共浙東區委收到了華中局轉發的黨中央關于北撤的急電，要求北撤“越快越好”，并“留下秘密工作及少數秘密武裝”。9月30日新四軍浙東縱隊和黨政軍機關共1.5萬余人開始北撤，北撤前，對留守和堅持浙東斗爭作了部署，成立浙東縱隊留守處，負責處理北撤后事宜，留下少數干部和武裝，實行單線聯系的特派員聯絡員制度。
蘇浙軍區部隊北撤后，國民黨軍隊長驅直入，對原抗日根據地進行殘酷“清剿”。針對國民黨軍的“清剿”，四明特派員劉清揚要求黨員干部分散隱蔽，保存力量，做到“無聲無息”；形勢稍緩時，則采取“躲擊”策略，即保存有生力量，伺機打擊敵人，鎮壓為虎作倀、罪大惡極的反動分子。“三東”特派員王起秘密進入寧波城后，要求所有黨員都要以公開職業為掩護，隱蔽下來，利用合法手段開展斗爭。金蕭特派員馬青回去后，精簡非戰斗人員，成立若干武裝工作組分散活動。
在反“清剿”斗爭中，各地建立的“白皮紅心”政權發揮了重要作用。這些名義上的國民黨基層政權，實由愛國進步人士、基本群眾和秘密黨員擔任主要成員。他們冒著生命危險，掩護地下黨和游擊隊活動，傳遞情報，聯絡同志，營救被捕人員等，做了大量的工作。
1946年1月停戰協定簽訂，加上政治協商會議召開，浙東國民黨軍“清剿”出現松緩跡象，但也有國民黨地方當局利用“和談”進行誘降、誘捕活動。1946年2月，國民黨諸暨縣長、縣黨部書記長聯名致信馬青，以“合作”之名，邀馬青進城談判，并許以縣自衛總隊副總隊長之職，遭到馬青的嚴辭拒絕。但也有黨員干部輕信上當的。1946年11月上旬，諸（暨）義（烏）東（陽）特派員金平歐輕信國民黨義烏楂林鎮鎮長提出的“雙方進行談判合作，共同維護地方安寧”的謊言，帶人貿然前往談判，結果被繳槍殺害。
由于國民黨持續的“清剿”和封鎖，浙東各地黨組織與上級失去聯系。1946年春，臺屬聯絡員許少春通過上海地下黨的關系赴蘇北，與華中分局取得了聯系。華中分局分析了時局和敵我力量對比，重申在國統區的黨組織繼續執行隱蔽精干方針，指示浙東各地黨組織發動群眾，建立武裝，重新恢復根據地，并派回原浙東縱隊北撤的張任偉等3位軍事干部。
在艱苦卓絕的隱蔽斗爭中，由于浙東各地黨組織堅持依靠群眾、利用山區有利地形，適時轉變斗爭策略，因而渡過了難關，積蓄了有生力量。至1946年底，臺屬地區黨員發展到250余人，為內戰爆發后重建武裝，開展游擊戰爭打下了基礎。
重建武裝 打開局面
1946年6月全面內戰爆發后，經黨中央批準，浙東黨組織歸中共中央上海分局（后改為上海局）領導。1947年1月，上海分局在上海召開浙東工作會議，成立浙東工委，書記劉清揚，副書記馬青，委員王起。原浙東區委常委張瑞昌作為上海分局代表，駐浙東協助工作。會議決定，浙東黨組織立即從隱蔽狀態轉為公開武裝斗爭，開展以臺屬為中心的游擊戰爭，創建浙東根據地。
1947年春，浙東工委在臺屬地區的寧海白嶺根村（現為梅花村）召開浙東領導干部會議，張瑞昌、劉清揚、張任偉、許少春和臺屬一些縣黨組織負責人參加。會議號召浙東各地黨組織重建武裝，開展以臺屬為中心的游擊戰爭，恢復、創建根據地。這次會議標志著浙東黨組織統一領導游擊戰爭的開始。
這以后，各地積極聯絡失散、分散的同志歸隊，起出埋藏于地下的武器，重新投入戰斗。由于武器缺乏，浙東各地主要通過襲擊敵區鄉政府、警察所和自衛隊，繳獲敵人的武器來武裝自己。1946年11月19日，由馬青、周芝山和應飛（金華特派員）領導在嵊縣石璜繳獲3挺輕機槍、46支長短槍和數擔彈藥。這是全面內戰爆發后浙東黨組織重建武裝的先聲。12月4日，朱之光領導部隊在余姚天華戰斗中繳獲了輕機槍1挺、短槍2支、子彈200發。在臺屬工委的領導下，1947年10月23日，武工隊襲擊了三門縣藍田(現屬象山縣)區署，繳獲輕機槍1挺、沖鋒槍2支、步槍19支，建立了臺屬主力“鐵流”部隊。12月22日，在嵊西地下黨的幫助下，張任偉、周芝山率部不費一槍一彈，成功俘敵官兵80余人，繳獲輕機槍6挺、步槍39支、短槍9支和子彈2000發，對打開會稽地區的斗爭局面和重建浙東主力武裝發揮了重要作用。
為推動重建武裝斗爭，新組建的武裝采用原浙東部隊的番號，重新打出新四軍的旗號。1947年5月四明人民愛國自衛總隊成立，對外宣稱是“三五支隊第四中隊”?！叭逯ш牎痹瓰樾滤能娬銝|縱隊成立之前的簡稱，在群眾中享有威望。1947年7月，金蕭地區成立會稽山人民抗暴游擊司令部，布告上赫然署著：司令員彭林。彭林是原浙東新四軍金蕭支隊司令員，已隨軍北撤。7月，會稽“鞏固”部隊改稱抗戰時期諸（暨）義（烏）東（陽）根據地的“堅勇”部隊；三東地區的革命武裝更直接打出“新四軍浙東第四自衛大隊”的番號等等。雖然這些重建武裝與原新四軍部隊并非一回事，僅是借用其番號名義而已，但是同樣起到震懾敵人，鼓舞群眾的作用。
1948年1月，經上海局同意，浙東工委改為浙東臨時工作委員會（簡稱浙東臨工委），書記張瑞昌，副書記馬青，委員王起。浙東臨工委即在慈南孔岙召開擴大會議，決定建立主力武裝——浙東人民解放軍第三支隊，劉發清任支隊長，馬青兼政委。2月，浙東臨工委以浙贛鐵路為界，將原金蕭地區分為路東（會稽）、路西（金蕭）和路南3個地區，分建3個地區級黨的工委組織，加強領導，推動了該地區革命斗爭的發展。
5月，上海局為加強開辟浙東的力量，指示浦東兩支革命武裝共300余人，攜2挺重機槍、16挺輕機槍，南渡杭州灣進入四明山，被編為浙東人民解放軍第五支隊，支隊長儲貴彬，政委張凡。此舉震動了國民黨最高當局，蔣介石下達“徹底清剿”的手令。5月28日，浙東主力三五支隊在余姚上王崗山地與浙江保安隊2000余人激戰終日，以犧牲10余人的代價，斃傷敵100余人，俘30余人，繳獲輕機槍1挺、長短槍30多支。
在浙東重建武裝中，三東（東海）地區尤其舟山群島革命武裝發展較迅速，由黨領導和秘密控制的武裝發展到3支，約有800人。為加強開辟臺屬的力量，浙東臨工委決定調舟山一支武裝到臺屬。5月18日，王起親率東海游擊總隊主力140余人槍赴臺屬，途宿六橫島。不料行蹤泄露。適值衢州綏靖公署主任湯恩伯在定海視察，即督率海陸軍赴六橫“清剿”。在強敵圍攻下，部隊傷亡慘重。之后，國民黨海軍司令桂永清親抵舟山指揮，實施逐島“清剿”。舟山黨組織和武裝除事先撤離和突圍外，留下的悉數損失，包括黨秘密控制的國民黨定?？h警察局保安警察第二中隊近300人槍也全被繳械。這一次損失，不僅直接影響了開辟臺屬的斗爭，而且使黨長期艱苦經營起來的舟山海上革命戰略支點毀于一旦。
三東（東海）地區的斗爭遭挫，并未動搖浙東臨工委開辟臺屬的既定決心。張瑞昌率領一支主力武裝繼續轉戰于臺屬地區。11月22日，浙東武裝200余人在新昌馬坑等，以少勝多，擊潰國民黨軍第六十二旅及新昌地方武裝共1000余人的進攻，斃傷敵60余人，俘19人，繳獲六○炮一門和大批槍支彈藥。此戰的勝利和接著的雙港、澄譚等戰斗的勝利，不僅擴大了臺東、臺西游擊區，打開了臺屬斗爭的局面，而且基本實現了四明、會稽、路南、路西、臺屬5個地區連成一片的戰略目標。一個橫亙浙江中部的地域廣闊的浙東游擊根據地已經形成。至年底，四明地區已基本恢復原抗日時期老根據地的轄區范圍。路西地區的金蕭支隊經多次外線出擊，連戰皆捷，于次年1月西征，在皖南歙縣與唐輝率領的蘇浙皖人民解放軍皖浙總隊勝利會師，打通了與浙西、皖南的聯系。
配合大軍 解放浙江
1949年1月，隨著三大戰役的勝利結束，國民黨賴以統治的主要軍事力量已基本被摧毀。人民解放軍飲馬長江，準備渡江南下。根據上級黨的指示，浙東臨工委和武裝轉變斗爭策略，把爭取時間殲滅國民黨軍隊，配合和迎接解放大軍渡江南下作為首要任務。1月下旬，浙東臨工委機關、四明、臺屬武裝和從東海突圍的人員共700余人，在新昌回山村會師。浙東臨工委在這里召開了擴大會議，宣布成立浙東人民解放軍第二游擊縱隊（簡稱浙東縱隊），司令員馬青、政委張瑞昌、副司令員劉發清、參謀長張任偉、政治部主任諸敏。下轄6個支隊：第一支隊（金蕭），支隊長蔣明達，政委張凡；第二支隊（會稽），支隊長楊亦明，政委周芝山；第三支隊（縱隊主力），支隊長張任偉（兼），政委諸敏（兼）；第四支隊（臺屬），支隊長劉發清（兼），政委邵明；第五支隊（四明），支隊長儲貴彬，政委陳布衣；第六支隊（路南），支隊長應飛，政委卜明，共有武裝6000余人槍，其中輕重機槍100余挺。這是浙東重建武裝兩年多來，根據地軍民浴血奮戰的勝利成果。
會后，浙東游擊縱隊即部署攻打天臺縣城的戰斗。2月10日，在內應配合下，浙東縱隊攻克天臺縣城，殲敵300余人，繳獲輕重機槍7挺，長短槍358支，第二天部隊撤離縣城。這是解放戰爭時期浙江最早被游擊隊攻克的縣城，引起很大震動。2月17日，浙東縱隊又攻克三門縣城，俘敵縣長以下200余人，繳獲輕機槍7挺和一批槍支彈藥，并成立中共三門縣委和縣人民政府。以后國民黨軍一直未能重回三門，三門成為浙江最早解放的縣城。
隨著解放戰爭形勢的勝利發展，特別是1948年下半年以后，京、滬、杭、甬等城市大中專院校的許多學生到游擊根據地投筆從戎。他們中許多是參加愛國民主運動的共產黨員和積極分子，在地下黨的策劃下，通過秘密交通線轉移到游擊區的。中共杭州地下黨曾先后組織70余名學生到浙東游擊區，金華英士大學地下黨為浙東游擊區輸送了250余名知識青年，臨海琳山學校有近200名學生投奔到游擊區，等等。他們經過短期學習培訓，即分配到部隊和地方工作。1949 年1 月至浙東解放，路西（金蕭）地區先后舉辦7期培訓班，受訓660 人，其中大中專學生400 名，經考察有近百名學員在學習時加入中國共產黨。臺屬黨組織舉辦“燎原培訓班”，先后辦了5 期，培訓近500人，受訓學員多為青年學生。大批城市知識青年進入根據地，不僅為部隊輸送了新鮮血液，而且顯著提升了浙東縱隊的整體文化素質。
為了更好迎接配合大軍南下，2 月中旬浙東臨工委機關和縱隊部從臺西移駐會稽地區。這里遂成為浙東游擊根據地的指揮中心。
在這前后，浙東縱隊除在軍事上加強進攻外，同時還加緊政治爭取工作，策動國民黨軍政人員起義、投誠和接受和平改編。其中影響較大的有：1949年1月諸暨縣國民黨地方武裝350余人，在壽乃康、傅渭潮的率領下宣布起義。3月，國民黨分水縣縣長項作梁、松陽縣縣長祝更生、麗水縣縣長張慕槎率部起義。4月21日解放大軍渡江以后，23日駐守在奉化溪口的蔣介石警衛部隊第九支隊650余人，在支隊長方步舟率領下起義。中共金蕭工委湖州特派員趙民成功策反國民黨一區（湖州）專員於樹巒，於率部向解放大軍投誠。5月4日，國民黨第八十五軍第一一○師師長廖運升率8000余人在義烏黃宅（今屬浦江縣）起義。5月29日臨海縣縣長汪振國率部起義。同日，黃巖縣縣長朱焯率部起義。國民黨軍政人員的起義和投誠，加速了國民黨在浙東統治的崩潰。
4月21日，解放大軍勝利橫渡長江。浙東黨組織和武裝積極配合，攻打縣城，阻擊逃敵，同日，攻克磐安縣城，26日，攻克松陽縣城。4月30日起，浙東縱隊先后解放了分水、新登、臨安、富陽、蕭山、諸暨、桐廬、紹興、浦江、天臺等10縣。此外，浙東黨組織和武裝為迎接大軍，籌備軍糧，接管城市，維持治安等，做了大量工作。
5月3日，解放大軍三野七兵團第二十二軍解放省城杭州。16日，中共浙江省委發布《關于結束前浙東臨工委工作的決定》。21日，浙東縱隊與二十二軍在紹興會師。之后，浙東縱隊所部編入大軍或各軍分區，撤銷部隊原建制和番號。指戰員隨大軍繼續參加解放寧波、舟山等戰斗，為迎接新中國誕生作出新的貢獻。