1938年，賴傳珠于皖南新四軍軍部
與毛澤東結下革命緣
賴傳珠雖然沒有參加湘贛邊界秋收起義，但卻是在1928年3月走上井岡山的中共最初的政工干部之一，是1928年2月18日中共贛南特委舉行的大埠、于都武裝暴動領導人之一。
與此同時，賴傳珠是一位軍政兼備、智勇雙全的將軍。他從連黨代表做起，后來相繼擔任大隊黨代表、支隊政委、團政委、師政委、縱隊政委、軍政委，一直做到兵團政委、大軍區政委，逐級逐崗、一步不落地擔任部隊政治主官，積累了豐富的政治工作經驗，成為卓有建樹的政治工作領導者。他還有一個與眾不同的任職經歷，就是在抗日戰爭期間，一直從事新四軍司令部領導機關的參謀長工作，先后擔任新四軍司令部參謀處處長、新四軍江北指揮部參謀長、華中新四軍八路軍總指揮部參謀長、新四軍參謀長，成為軍事領導機關的主要負責人，被譽為新四軍優秀參謀長之一。
賴傳珠還利用戰斗與工作的閑暇時間，先后寫下了《古田會議前后》《模范紅五團的新榮譽》《戰時政治工作研究》《抗戰四年來的新四軍》《目前參謀工作的具體任務》《關于改善我們部隊的管理教育問題》等許多高質量文章，把部隊政治工作和軍事工作的實踐經驗上升到理論高度，對部隊建設起到了重要的指導作用。
賴傳珠與毛澤東結下的革命緣很早。1928年3月下旬，大埠暴動失敗以后，他經特委介紹，上井岡山去找毛澤東領導的秋收起義隊伍。但晉見毛澤東時，賴傳珠還費了一番周折。他們一行三人從于都縣步前崗出發，快走到井岡山時，聽說毛澤東已經率部下山到湖南去了；他們又折轉往南，跨過湘贛邊界，追到湘南的桂東縣；快到3月底時，賴傳珠在沙田村終于遇到毛澤東。這時，毛澤東正率領工農革命軍第一軍第一師向汝城攻擊前進。賴傳珠見到毛澤東后，立即匯報了大埠暴動的前因后果，并堅決要求參加工農革命軍。毛澤東同賴傳珠促膝長談，歡迎他參軍。部隊占據汝城后，賴傳珠被分配到工農部工作。工農部是政治部的最初雛形。
4月上旬，部隊返回井岡山到達酃縣時，賴傳珠調任第一師特務連黨代表，負責毛澤東和師部的警衛工作。可見毛澤東對他的信任和賞識。主要原因：一是賴傳珠的文化程度較高，讀過私塾，念過高小，還在贛南中學讀了初中，這在當時是典型的知識分子。二是賴傳珠雖出身于小地主兼商人家庭，但整個家族都同情革命。在大埠暴動前，父親出資給賴傳珠購買槍支，支持革命。大埠暴動失敗后，賴傳珠家中的房屋全部被國民黨和靖衛團燒毀，田地被沒收，母親、伯父、叔父被吊打致傷，父親避走信豐鄉間。這樣，賴傳珠的家庭又成為革命的家庭。三是賴傳珠為贛南人，離井岡山很近，熟悉這里的人文風貌。
4月下旬，朱德和毛澤東在井岡山勝利會師，所率領的部隊合編為工農革命軍第四軍。5月3日，賴傳珠調任第三十一團衛生隊黨代表，之后又任團部宣傳隊隊長，第二縱隊政治部組織科科長，第四支隊第十二大隊黨代表。
這期間，賴傳珠耳濡目染，深受毛澤東的言傳身教，進步很大。毛澤東創立了給紅軍官兵上政治課的教育形式。組織主要以營為單位，由營黨代表講課；有時也以連為單位，由連黨代表上課。內容主要是講紅軍的性質、任務、宗旨，說明紅軍是工人、農民的軍隊，是為勞苦大眾求解放的。毛澤東經常親自上政治課，強調要把紅軍建設成一支新型軍隊，必須嚴格執行紀律，并為此創立了通俗易懂的“三大紀律、六項注意”。賴傳珠是文化人，又有搞工農運動的實踐經驗，他留心學習毛澤東理論聯系實際的講課方法，把革命道理明白易懂地講給戰士聽，很受大家的歡迎。回連隊后，他模范地執行紅軍紀律，言傳身教地管理好連隊。
1929年12月，時任第四支隊第十二大隊黨代表的賴傳珠，出席了在閩北古田召開的紅四軍第九次黨代表大會，即在中共黨史上占有重要地位的“古田會議”。賴傳珠參加了關于克服非組織觀點小組的討論。會后回到大隊，賴傳珠立即開會傳達和進行對照檢查，最后以黨支部的名義向全大隊重申不許打罵士兵等紀律。古田會議后，1930年1月，賴傳珠升任第四支隊政委。他把毛澤東關于紅軍管理教育方法七條原則當做座右銘，使自己逐步成為紅軍中一名出色的政治工作者。
時光轉到1935年10月下旬，當年井岡山時期的紅軍已發展壯大為紅一方面軍，并且勝利完成艱苦卓絕的二萬五千里長征。賴傳珠也成長為這支紅軍主力部隊的著名“紅一師”政委。不久，又因工作需要，調到紅一方面軍司令部。這是賴傳珠革命軍事生涯的一大轉變與跨越，從此時起，直到抗日戰爭結束，他由長期做政治工作轉行搞軍事工作，也由一名合格的師政委成長為著名的新四軍參謀長。
參加秋收起義部分同志1937年在延安合影
新四軍中的高級參謀長
高級參謀長主要負責積極認真地輔佐軍事主官做好軍事工作，提出好的作戰參考意見，謀劃作戰部署，上傳下達軍事任務和命令。
1938年1月6日，從延安輾轉到達武漢的賴傳珠隨新四軍副軍長項英和軍部機關大部分干部移駐南昌。賴傳珠出任新四軍司令部參謀處處長兼作戰科科長。這個職務不大不小，卻非常具體實際，在核心樞紐中起著親歷親為的關鍵作用。首先是上傳下達，即主要協助參謀長張云逸、副參謀長周子昆做好司令部的參謀工作；有時按葉挺軍長、項英副軍長的意圖，安排工作，分配干部；還不時接待來自福建、廣東、江西等各地游擊隊的同志，商談改編與調動事宜。比如，蔣介石電報限令長江以南新四軍各支隊到安徽省歙縣巖寺地區集中，賴傳珠便立即電告正在外地的葉挺、項英和周子昆，同時下達通知各支隊制定行軍路線，電告出動日期。其次是出謀劃策，即主要輔佐新四軍首長謀劃作戰部署。比如，正在武漢、廣東籌措經費、槍械物資的軍長葉挺趕回南昌后，賴傳珠隨即把收集整理的各部隊下山集中情況、計劃行軍路線的地圖、文稿和統計表冊等材料送給葉挺，為葉挺了解新四軍全軍的動態，提供決策依據。第三是具體落實軍事工作和日常事務。比如，為了使各支隊盡快進入敵后開展游擊戰爭，賴傳珠按照軍首長意圖立即部署整訓工作，從政治、軍事、后勤等方面加強部隊建設，提高指戰員的政治覺悟和軍事素質。為了幫助部隊挺進敵后做好準備，賴傳珠協助第二支隊副司令員粟裕抽調三個支隊的偵察連和部分干部組成先遣支隊，深入蘇南敵后進行偵察。為了接受國民黨軍第三戰區的點驗，賴傳珠還協助軍首長組織皖南新四軍部隊進行有效準備，以保證部隊應有的軍餉和物資正常到位，并不被克扣。為了用事實回駁國民黨指責新四軍“游而不擊”的無恥讕言，賴傳珠于1938年底匯集了一年來新四軍的戰績，并電報國民黨軍第三戰區轉報蔣介石。這一做法，得到了毛澤東的肯定。平時，賴傳珠親自起草參謀工作計劃和干部教育計劃，組織參謀處的干部學習和訓練，親自講授游擊戰爭課。此間，賴傳珠還寫出了一年來與日軍作戰的戰術及經驗教訓總結。
1939年5月中旬，新四軍江北指揮部在皖中廬江縣東湯池成立，新四軍參謀長張云逸兼任指揮部指揮。賴傳珠由軍部參謀處處長升任指揮部參謀長，繼續輔佐張云逸，并正式走上高級參謀長崗位。12月下旬，江北指揮部副指揮兼第四支隊司令員徐海東具體指揮皖東全椒縣周家崗伏擊戰，賴傳珠在指揮部積極協助配合，為新四軍江北部隊在津浦路西首次反掃蕩斗爭勝利作出了應有的貢獻。到1939年底，新四軍江北部隊由4000人發展到8000人，初步完成了在皖東的戰略展開，江北指揮部也由皖中移駐皖東地區。
1943 年，華中局組織部長曾山（左一）、新四軍軍長陳毅（左二）、新四軍參謀長賴傳珠（左三）、
新四軍政委饒漱石（左四）在黃花塘軍部
1938年賴傳珠在云嶺新四軍軍部任參謀長時留影
進軍蘇北抗敵頑
1940年1月5日，中共中央政治局候補委員、中共中原局書記劉少奇專門到皖東定遠縣得勝集賴傳珠處講談新四軍總的任務。
劉少奇強調：新四軍的發展方向不是向北，不是向西，更不是向南，而應該按照中共中央的戰略意圖向東發展。賴傳珠對劉少奇這位華中地區敵后抗日斗爭的最高領導人特別敬重。
賴傳珠回答：據自己的理解，東邊的蘇北地區有幾大優勢。一是地域遼闊，完全在敵后地區，相對比較安全，有馳騁發展的空間；二是向北靠近山東，有利于和八路軍相互策應；三是人民群眾對國民黨欺壓百姓恨之入骨，歡迎新四軍東進蘇北。
當時，新四軍黨內對東進發展蘇北還存在不同意見，劉少奇主張東進蘇北。賴傳珠則堅定地支持劉少奇，認為劉少奇堅持把蘇北作為新四軍的戰略發展方向是正確的。劉少奇對賴傳珠的政治敏銳性大加贊賞。作為指揮部參謀長，賴傳珠也決心協助劉少奇、張云逸等把第四、第五支隊建設成為堅持皖東、發展蘇北的重要力量。
1月中旬，劉少奇在定遠縣山黃家村主持召開中共中原局第二次會議。針對“一切經過統一戰線”問題，劉少奇有不同看法：在統一戰線中必須保持黨和軍隊政治上、組織上、工作上的獨立性，在國民黨頑固派執行其防共、反共政策時，要強調斗爭，不應該強調統一。如果“一切經過統一戰線”， 就是一切經過國民黨，就等于把自己的手腳捆了起來。抗日民主政權是人民的，國民黨不批準，只要人民承認，我們的政權就可以存在，就可以籌糧、籌款、收稅。
賴傳珠完全贊同劉少奇的意見。這次會議強調了建立抗日根據地、建立抗日民主政權、發展抗日武裝的極端重要性，明確了在華中首先在皖東建立抗日根據地的方針和任務。
2月中旬，第四支隊合并到江北指揮部。賴傳珠參謀長肩上的擔子更重了。他夜以繼日地協助劉少奇、張云逸指揮抗日和反頑作戰，處理部隊的各項問題。
首先是津浦路西反磨擦戰斗，反擊頑軍的進攻。此時，國民黨第二十一集團軍司令李品仙和江蘇省政府代理主席韓德勤，按照蔣介石的“進剿”計劃，各率頑軍企圖東西夾擊新四軍江北部隊。針對這一嚴峻局勢，江北指揮部決定首先集中兵力于津浦路西，反擊地方頑軍，鞏固路西陣地。3月4日，路西反“磨擦”戰斗打響。賴傳珠按照劉少奇、張云逸的指示，制定了主動跳出包圍圈，求得在運動中殲敵的戰法。江北部隊先奪取定遠縣城，以調動頑軍第十二游擊縱隊回援，至12日，取得殲滅頑軍第十二游擊縱隊大部、第十游擊縱隊一部共2000余人的勝利。
接著是半塔集保衛戰，再次粉碎頑軍的進攻。3月21日拂曉，韓德勤以兩個團向第五支隊駐地接近。中午時分，搶占了來安縣半塔集西北制高點光山，完成了對半塔集的包圍。第五支隊副司令員周駿鳴當機立斷，親率特務營由半塔集西北山后，隱蔽接近敵人，并令駐守半塔集的教導大隊從正面配合，向敵人突然發起沖鋒，迫敵退至賈大山，新四軍重新控制了制高點。
3月22日，賴傳珠受中原局、新四軍江北指揮部委托去電指示：動員和組織一切力量，堅守半塔集。待路西主力揮戈東援，殲滅韓頑。當日晚，第五支隊參謀長趙啟民進入半塔集，傳達賴傳珠指示，組織部隊，固守半塔集，以待援軍。23日，江南指揮部指揮陳毅電令蘇中挺進縱隊兼程前進，增援半塔集。26日，葉飛率挺進縱隊到達皖東地區。與此同時，江北指揮部指揮張云逸率路西部隊擊潰桂系頑軍李品仙之后，又兼程東返半塔集西南40里的張山集。韓德勤得悉新四軍東西援軍逼近，于是全線動搖，倉皇后撤。
3月29日，賴傳珠授命新四軍分三股全線反擊。第五支隊一部與陶勇蘇皖支隊從中路突破，直插半塔集東北之王店集、蓮塘、張公鋪一帶，與韓頑常備第十旅激戰，將敵擊潰。第五支隊乘勝向西北追殲逃敵，與韓頑秦慶霖部三個團激戰，打得敵人大敗。第四支隊主力在半塔集東南配合挺進縱隊向韓頑獨立旅發起攻擊，把敵人一直趕到三河右岸。至此，半塔集保衛戰取得了完全勝利。
第三是組織主力部隊地方化，幫助建立地方武裝。4月上旬，賴傳珠奉命組織部隊以營為單位到各縣幫助建立地方武裝，相繼成立了縣大隊、區中隊。短短4個多月，全區脫產的縣區武裝發展到9000余人，不脫產的人民自衛軍發展到近10萬人。
第四是歡迎八路軍戰友協同新四軍發展蘇北。8月中旬，八路軍第二縱隊政治委員黃克誠率新編第二旅和第三四四旅等部南下華中，賴傳珠組織江北指揮部人員召開文藝晚會熱烈歡迎，并給八路軍部隊送豬肉等食品。
1940年11月17日，華中新四軍八路軍總指揮部在蘇北海安城的西寺正式成立。中共中央決定，葉挺為總指揮，劉少奇任政治委員，陳毅為副總指揮，賴傳珠為參謀長，統一指揮蘇北、江北地區的新四軍、八路軍部隊。華中新四軍八路軍總指揮部成立后，中國人民抗日軍政大學第五分校在鹽城成立，陳毅兼任校長，賴傳珠兼任政治委員。
1941年1月3日，組織上又決定賴傳珠兼任八路軍第五縱隊副司令員。至此，賴傳珠在華中新四軍八路軍的政治地位和軍事指揮權更上一個臺階。
1939年春，賴傳珠與新四軍參謀長兼江北指揮部指揮張云逸（右）合影
軍部重建再立功
1月上旬，皖南事變發生，新四軍軍部突遭國民黨軍重創。1月下旬，新四軍軍部重建。在此期間，賴傳珠先是作為華中新四軍八路軍總指揮部參謀長，繼而又作為重建后的新四軍參謀長，在這段風云變幻、相當困難的日子里，為軍部救援、部隊接應和軍部重建等重要工作，日夜操勞，全力輔佐陳毅、劉少奇等軍政首長，有效地完成了一系列重要任務。
11日，在鹽城遭日軍飛機空襲的警報聲中，賴傳珠收到皖南軍部發來遭國民黨軍突襲包圍已至絕境的電報。他立即將此情況報告中共中央，并與劉少奇、陳毅研究救援之策。14日，新四軍北移部隊近萬人，經浴血奮戰，除2000余人突出重圍外，大部壯烈犧牲或被捕，軍長葉挺下山談判被國民黨扣押。對此，賴傳珠帶著憤恨和悲痛，立即布置江北部隊到無為、巢縣一帶接應軍部突圍人員。25日下午，新四軍軍部重建大會在鹽城隆重召開，陳毅、劉少奇和新四軍指戰員及鹽城各界代表1000余人參加大會。賴傳珠作為參謀長主持大會。軍部重新建立后，賴傳珠積極協助陳毅、劉少奇將新四軍全軍9萬余人整編為七個師、一個獨立旅、抗大第五分校及特務團。從擬定編制、劃分防區、調整部隊，到作戰計劃、任務部署、命令下達，賴傳珠在簡陋的工作案頭，指揮司令部機關的部門領導和參謀人員有條不紊地忙碌著、進行著、完成著。從此，賴傳珠作為新四軍的“大管家”而努力奮斗，并為新四軍的再次發展壯大立下了汗馬功勞。
1939年夏，賴傳珠在東湯池與新四軍軍長葉挺(左一）、
參謀長張云逸（右一）、新四軍第五支隊司令員羅炳輝（右二）合影
戰場驅馳反掃蕩
1941年6月中旬，賴傳珠獲悉日軍準備于7月開始發動空前規模的大掃蕩，企圖再度重創直到消滅重建的新四軍軍部。隨即，他擬定方案協助劉少奇、陳毅秘密疏散部隊。至7月10日，在賴傳珠具體組織下，軍部、中共華中局隨劉少奇、陳毅撤離鹽城，安全移駐到建湖鎮北左家莊。不久，日軍占領鹽城，但撲了空，惱怒之余，又調來許多特制的裝甲汽艇，在空軍、步兵、騎兵的配合下，到處搜尋新四軍軍部，卻處處碰壁。而劉少奇和陳毅為了保證軍部和華中局的指揮不間斷，則分散行動。這期間，賴傳珠率兩個連及直屬隊隨劉少奇一起，指導整個華中工作。后來，賴傳珠協助陳毅謀兵布陣，以第三師主力和第一師一部及軍部特務團等部隊，先在內線予以來犯之敵阻擊和殺傷，再轉入日偽軍的側后，以游擊戰展開攻勢；同時派第一師第一旅等部隊，向海（安）泰（興）線、南（通）如（皋）線發起攻勢作戰，連克天皇橋、季家市、黃橋等日偽據點，一舉打到日偽軍的戰略支撐點泰州、泰興城下，使掃蕩蘇北之日偽軍顧此失彼。8月初，日偽軍大部分兵力被迫自鹽城、阜寧地區倉皇南撤。當日偽軍舉兵蘇中之時，蘇北新四軍部隊則大舉反擊，第三師主力收復阜寧、東溝、益林等地，第一師第二旅攻克鹽城東南的裕華鎮，全殲日偽守軍。新四軍各部隊在劉少奇、陳毅、賴傳珠的領導和指揮下，不怕疲勞，不怕犧牲，經過一個多月的英勇作戰，徹底粉碎了日偽軍對蘇北、蘇中同時發動的大掃蕩，共斃、傷、俘日偽軍3800余人，擊沉日軍裝甲汽艇30余艘，取得了反掃蕩的勝利。
1942年11月14日，日偽軍1.1萬余人在騎兵、坦克、飛機的配合下，分別向淮海區和淮北區進行掃蕩和反復清剿。賴傳珠協助陳毅一邊組織根據地軍民以搬光、藏光、走光的辦法，對付日軍燒光、殺光、搶光的“三光”政策；一邊指揮第三、第四師部隊跳出日軍合圍圈，轉移至日偽軍側后，積極尋機打擊日偽軍。經過33天艱苦戰斗，粉碎了日偽軍的冬季掃蕩。
1942年底至次年2月，日軍增兵3萬余人，又對鹽城、阜寧地區實行第二次大掃蕩。賴傳珠根據陳毅的部署和意圖，一面組織華中局和軍部分為3個梯隊秘密轉移，一面具體組織指揮各部隊粉碎日偽軍的大掃蕩和擊退入侵淮北根據地的國民黨頑軍。3月18日，新四軍第四師于山子頭生擒國民黨江蘇省政府主席韓德勤，賴傳珠當日將俘韓情況上報中共中央和第十八集團軍總部，并組織精干隨員跟陳毅去第四師處理釋放韓德勤事宜。
1944年1月，賴傳珠被增補為中共華中局常委。7月11日，張云逸、賴傳珠等根據日軍向中原腹地大舉進攻的危險情勢，聯名致電毛澤東等，提出實現貫通中原戰略方針的建議。接著，中共中央正式下達了打擊日軍，向河南敵后進軍的部署，賴傳珠協助張云逸組織第四師主力由師長彭雪楓率領西進，恢復原豫皖蘇邊區；再調第五師李先念部北上，開辟豫南、豫中抗日根據地。
8月22日，毛澤東、劉少奇和當時在延安的陳毅致電張云逸、饒漱石、賴傳珠，提出整訓部隊的內容和要求。賴傳珠依據中央指示擬定了新四軍軍政訓練的具體計劃，并堅持每周聽一次司令部各科匯報，有針對性地寓教育于匯報會之中，不斷提高參謀人員的工作水平。
賴傳珠在實際工作中，注意總結思考，常常自己動手寫材料。抗日戰爭以來，他先后寫了《江南日人后方游擊戰的一般情況》《對今后部隊軍事教育的意見》《抗戰四年來的新四軍》《戰時政治工作研究》《目前參謀工作的具體任務》《新四軍的前身及其組成與發展經過概況》《關于改善我們部隊的管理教育問題》等文章，對部隊建設起到了重要的指導作用。
1944年秋，中共中央根據國際反法西斯形勢的變化，審時度勢，明確新四軍的主要任務是在江南大發展，以便在未來戰略大反攻時配合盟軍登陸。賴傳珠積極參與制定南下開辟新區的行動部署，組織第一師師長粟裕、副師長葉飛先后率兩批部隊渡江南下。接著，粟裕、葉飛指揮南下部隊在1945年上半年粉碎了日偽軍的多次進攻，取得了天目山地區三次自衛反頑戰役的勝利，開辟了蘇浙皖邊敵后新區，初步完成了發展東南的戰略任務。